当然，不同的科仪包含的教义内容不尽相同，这是由科仪行为的目的、要求和表现形式决定的。
其次，在各种科仪中，都包含有忏悔罪错、解冤释结的内容。
在《斗姥炼度金科》中在“志心召请”“二十四门苦爽、三十六类伤亡”后，有许多解冤释结的诵白，其中有称“切以积愤成冤，虽戴天而必复，欺心负债，诚切己以难忘。纵侥幸于人间，必牵缠于泉下。念念不忘，冤冤相报，以今请降符章，解释累世冤对，共离苦趣，各遂生方”。
科书中有行仪提示“师结北斗诀，存想自己恩怨两忘，一切冤仇解释”。
又如《宥罪赐福宝忏》中的“除罪、成真”两段，道众替代亡灵忏悔，愿消除“不孝父母罪、不敬天地罪、肆意任心罪、顺邪弃正罪，荤口读诵罪、邪淫妄语罪、无恭敬心罪”等各种罪孽，达到“按妙典以忏除，求诸障之扫荡”，同
时，希望此魂来世能够“得证功德身、神通身、慈悲身、良翳身、光明身、自在身等”，“身度三界与道常存”。
这样的经文，言简意赅，通俗易懂，道众在为信众举行超度祖先科仪的过程，其实也是对信众和自己进行思想道德教育的过程，相得益彰。
在科仪中，都包含有归依、戒律和愿望的内容。
斋天科仪中的“十二愿”即“一愿乾坤明素，二愿气象清圆，三愿主躬康泰，四愿民族和睦，五愿天垂甘露，六愿地发祥烟，七愿四时顺序，八愿万物生全，九愿家多孝悌，十愿国富才贤，十一愿天下和平，十二愿正道兴行”，体现了道门对太平社会的理想愿望。
而且，各种科仪行仪时都有皈依道、经、师三宝的内容，在戒律上也体现“戒杀、戒盗、戒淫、戒妄语、戒茹荤、戒不敬三宝”等宗教思想，希望道众能“奉戒专一，冥心大道”，这对行仪的道士都有教育意义和修持功能。
道教科仪中的包涵着养生思想：
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